Hola Raúl, ya sabes que en general no deben hacerse peticiones de documentación en los foros.
Dicho lo cual, no sé si has explicado bien tu caso. Me huele a que a tu cliente (el titular del "bareto") le habrá llegado el informe de la solicitud presentada para la actividad y en el mismo, además de incluirse eventuales deficiencias técnicas del proyecto, se incluye además la exigencia de que para poner en marcha la actividad deberá presentar lo relativo al sistema de autocontrol.
El responsable de la higiene en un establecimiento es su titular, por lo que es dicho titular (o quien él designe) quien deberá realizar las actividades de autocontrol. El programa que contenga esas actividades suele realizarlo las empresas del sector.
De todos modos, si tu cliente te lo ha encargado a ti, puedes guiarte con esto
http://www.juntadeandalucia.es/salud/li ... ontrol.pdf